Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms