Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms