Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms