Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PSMB4P28070 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PSMB4P28070 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PSMB4P28070 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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