Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XPAP23025 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XPAP23025 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XPAP23025 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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