Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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