Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms