Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DESP17661 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DESP17661 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DESP17661 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms