Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms