Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM10L2BP0DMW5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms