Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC175P0C221 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms