Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRCP08575 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRCP08575 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRCP08575 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRCP08575 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRCP08575 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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