Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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IFNB1P01574 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFNB1P01574 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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