Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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