Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms