Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms