Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms