Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms