Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms