Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms