Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms