Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms