Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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