Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms