Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms