Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms