Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms