Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms