Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF439Q8NDP4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms