Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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