Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms