Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms