Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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