Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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