Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTCH1Q13635 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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