Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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