Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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