Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms