Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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