Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms