Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms