Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP5P82980 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms