Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP46P62068 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP46P62068 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP46P62068 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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