Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.5 ms