Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAD23AP54725 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAD23AP54725 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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