Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFE3P19532 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFE3P19532 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFE3P19532 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms