Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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