Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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