Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms