Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TOP1P11387 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TOP1P11387 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms